霉菌毒素是很多鸡病的根源，鸡霉菌毒素中毒会影响鸡的消化功能，导致饲料便发生。

鸡的肠道细菌群紊乱会直接影响鸡小肠的消化功能。鸡小肠消化功能下降后无法消化饲料，从而导致饲料便。另外，肠道细菌群紊乱容易引发梭菌的繁殖，使得鸡肠道发生坏死性炎症，造成鸡肠道渗出增多，从而出现饲料便。

鸡小肠球虫会直接导致小肠的炎症，同时还会造成浆液性渗出增多。小肠的炎症会大大降低饲料消化率，使得饲料未经消化即被排出体外。鸡小肠球虫若不及时**，会出现出血的情况。

鸡若患有绦虫线虫等疾病，同样会使肠道受损而产生炎症，降低鸡的消化功能，增多浆液性渗出，导致饲料便发生。

鸡在饲养过程中，由于某些原因造成了肠道损伤，导致肠黏膜脱落。鸡的肠黏膜脱落后在肠道覆盖，形成的厌氧环境很有利于梭菌的生长。梭菌的生长会让鸡肠道发生坏死性的炎症，增多肠道渗出，导致饲料便发生。

一些养鸡户选择的饲料不当，也可能会造成鸡拉饲料便。